Vorlesung Mi 10:05-11:35 SemRm 2
Übung Mi 11:45-13:30 Poolraum 1
Beginn 4. April 2012
Michael Martins
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Das Programmpaket GAMESS wird in der Übung zur Berechnung der geometrischen und elektronischen Struktur von Clustern berechnet werden.
Der Download ist nach einer Registrierung und Annahme der Lizenzbedingungen unter . Die Dokumentation ist als pdf Datei zugänglich.
Zum Erstellen der Eingabedateien, aber auch zur graphischen Darstellung der Ergebnisse ist das Programm wxmacmolplt sehr gut geeignet. Hier ist der Download für die verschiedene Betriebssystemen (Linux, Windows, OSX) unter http://www.scl.ameslab.gov/~brett/MacMolPlt/ möglich.
Sowohl wxmacmolplt als auch das Paket GAMESS werden auf dem Rechnern des PC-POOL 1 installiert und dort unter Ubunti nutzbar sein.
Installation unter Windows
Ausführen
- wxmacmolplt aufrufen
- Eingabedatei als .inp Datei abspeichern
- Aus dem wingamess Verzeichnis die Datei batmaker starten
- Die vorher erzeugte .inp Datei in die Liste einfügen und die Bat-Datei speichern
- Aus dem Wingamess Verzeichnis die Datei jobs.bat starten. Beim ersten Aufruf sollten einige Meldungen kommen, daß auf verschiedene Dateien zugegriffen werden soll
- In einem neuen Fenster sollte dann angezeigt werden, daß das Programm läuft. Nach erfolgreichem Lauf sollte sich dieses Fenster automatisch schliessen
- In dem Verzeichnis, in dem .inp datei erzeugt wurde sollte jetzt eine .log Datei stehen, die den Output des Programmes enthält. Diese Datei kann jetzt mit wxmacmolplt oder Wordpad geöffnet werden
Aufruf:
log2eigenvalue.awk logfile > ausgabe.dat
Matlab Skripte, um Elektronenspektren zu berechnen
%% Lade das Datenfile in die Variable ebind
>> ebind = load('beispiel.dat');
%% Berechne für den Bereich von -350 bis +1 eV in 0.1eV Schritten
>> erg = -350:0.1:1;
%% Berechne das Elektronenspektrum mit einer Energieauflösung von 0.5
>> spec = pes(erg , ebind*27.2 , 0.5);
%% Plotte das Spectrum
>> plot(erg,spec);
Anstelle von matlab können sie auch das kostenlose octave verwenden
